Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EYA3Q99504 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EYA3Q99504 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms