Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP53Q96M91 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP53Q96M91 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms