Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC7Q96M83 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms