Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms