Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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