Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZA3Q96KX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZA3Q96KX2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms