Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG3Q96JB2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG3Q96JB2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms