Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC11Q96J66 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC11Q96J66 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms