Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTERF3Q96E29 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms