Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C18orf8Q96DM3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms