Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL1Q8WXF7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms