Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN1Q8WXD9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN1Q8WXD9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms