Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD12Q8N8I0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms