Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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C9orf40Q8IXQ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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C9orf40Q8IXQ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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C9orf40Q8IXQ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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