Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC83Q8IWF9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms