Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms