Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms