Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APTXQ7Z2E3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms