Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH2Q76I76 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH2Q76I76 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms