Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PREX2Q70Z35 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PREX2Q70Z35 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms