Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP47Q6ZTR5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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