Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms