Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC141Q6ZP82 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms