Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC27Q6UX04 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms