Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms