Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms