Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms