Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 RPL22L1-201ENST00000295830 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 RPL22L1-204ENST00000475836 581 ntTSL 1 (best)6.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 C8orf33-204ENST00000530455 2676 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 KCTD3-202ENST00000448333 751 ntTSL 28.21□□□□□ -1.097e-8■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 GADD45B-205ENST00000587887 276 ntTSL 1 (best)13.9□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 32.8
PRPF8Q6P2Q9 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 32.8
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PRPF8Q6P2Q9 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 32.8
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