Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms