Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms