Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF648Q5T619 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms