Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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COL5A1-AS1Q5SY13 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COL5A1-AS1Q5SY13 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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