Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF628Q5EBL2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF628Q5EBL2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms