Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms