Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL12Q53G59 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms