Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF3Q3KNV8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms