Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms