Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF4BQ2VIQ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4BQ2VIQ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4BQ2VIQ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF4BQ2VIQ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms