Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms