Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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