Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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FOXD1Q16676 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXD1Q16676 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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FOXD1Q16676 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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FOXD1Q16676 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
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FOXD1Q16676 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD1Q16676 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
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