Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms