Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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