Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms