Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TCEA2Q15560 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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