Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDGFRLQ15198 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms