Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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