Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIDRQ14159 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms