Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms