Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOFQ13790 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms